3. Adaptif İzler
Doğal seleksiyon, gen havuzlarının nesiller boyunca çevresel koşullara adapte olmasına yol açan ana evrimsel mekanizmadır. Bu nedenle, örneğin kuru habitatlarda yetişen popülasyonların, yerel olarak adapte olmaları ve yetersiz su kullanılabilirliği ile başa çıkmak için evrimleşmeleri beklenir.
İP 3, bölgesel ve bölgeler arası (kıtasal) ölçekte meşe genomunda kuraklık adaptasyonunun izlerini inceleyecektir. Çalışılan her popülasyonun çevresel verileri (iklimsel ve edafik) ve genom çapında allel frekans paternleri kullanılarak, fenotipik seçilim altındaki lokuslar saptanabilir.

Görevler:
-
Çevresel veri seti toplama (ör. topografik, iklimsel veya toprak değişkenleri)
-
Yeni nesil dizileme (NGS) ile meşe genomunun bilinen genlerini hedefleyerek ekzom yakalama
-
Genetik belirteçlerin analizi (tek nükleotid polimorfizmleri – SNP'ler)
-
Çevresel veriler ve SNP allel frekansları arasındaki ilişkiler
İP koordinasyonu: BOKU (lider), WSL (yardımcı lider)