4. Genotip X Fenotip ilişkileri
İP 3'de belirtildiği gibi, kurak alanlarda kuraklıkla ilgili fenotipik özelliklerin hem bölgesel hem de bölgeler arası ölçekte doğal seçilim yoluyla şekillendirilmesini bekliyoruz. İP 4'de doğal seçilim altında fenotipik özellikleri inceliyoruz ve bunları genetik varyasyonla ilişkilendiriyoruz.
Tüm çalışma alanını kapsayan seçilmiş popülasyonların çeşitli morfolojik ve fizyolojik parametrelerini (fenotipik özellikler) değerlendireceğiz. Bu, her biri oldukça nemli ve kurak iki bölgede, çok sayıda farklı soyla (açıkça etiketlenmiş) kurulacak iki ortak bahçe denemesi ile başarılacaktır. Böylece, genetiğin fenotip üzerindeki etkisini çevresel etkilerden ayırmamızı sağlayacak ve bir dereceye kadar, Provenansın (orijin) yerel (bölgesel) olarak adapte olup olmadığını değerlendirmemize izin verecektir. Ayrıca, kuraklık adaptasyonu ile ilgili morfolojik ve fizyolojik özellikleri belirlememizi sağlayacaktır.
S
Son olarak, iki denemenin bireyleri çok sayıda aday gen için genotiplenecektir. Genom çapında ilişkilendirme çalışması (GWAS) kullanarak, söz konusu fenotipik özelliklerin altında yatan genleri ortaya çıkaracağız ve adaptasyonun izleri hakkında ek kanıtlar sunacağız.


Provenans (orijin): ormancılıkta belirli bir coğrafi konum ve büyüme özellikleri ile karakterize edilen bir grup birey için kullanılan terim
Görevler:
-
Ortak bahçe denemeleri ve fide yönetimini kurmak
-
Morfolojik, fenolojik ve fizyolojik parametreleri değerlendirmek
-
Popülasyonlar arasında farklılık gösteren özellikleri genetik yöntemlerle belirlemek
-
Aday genlerdeki soyları genotiplemek
-
GWAS kullanarak fenotipik özelliklerin altında yatan genleri ortaya çıkarmak
İP koordinasyonu: WSL (lider), ODTÜ/TAGEM (yardımcı lider)